AACRニュース: 患者を研究パートナーとして
新たなプラットフォームにより、患者はどこに住んでいても臨床データや腫瘍組織を共有することができ、誰もが研究に参加できるチャンスが得られます。
エリン・オドネル著
2024年9月20日
カイル・ブリュイングトン（Kyle Brewington）さん(32)にとって、がんは2006年から現実のものとなっています。13歳の時に左脛骨の骨肉腫と診断されたのでした。10年後、がんは再発しました。2022年、ミズーリ州フレデリックタウン在住のブリュイングトンさんは、別の癌である腎細胞癌と診断されました。癌患者向けのFacebookページをスクロールしていると、臨床データや腫瘍サンプルを研究に提供することをグループのメンバーに呼びかける投稿を目にしました。
その投稿をした人物は、マサチューセッツ州ケンブリッジにあるMITとハーバード大学のブロード研究所が立ち上げたプログラム「Count Me In (CMI)」に最近、自身のデータを寄付したばかりでした。 ブリュイングトンさんは、がんの背後にある科学に興味をそそられ、CMIとブロード研究所の研究について読み始めました。 ブロード研究所の広範なウェブサイトを調べた結果、このプログラムには十分な資金が投入されていると結論付けたことを覚えています。「深く掘り下げて調べていくうちに、『これは本物だ』と思いました」と彼は言います。
CMIに参加することを選択した場合、同プログラムが各担当医に連絡して彼の医療記録や過去の外科手術で切除された腫瘍のサンプルを要求することを許可する同意書に署名することになることを彼は知りました。また、調査票への記入や、ゲノム配列決定用の唾液や血液の提出も行うことになります。これらのデータは匿名化され、がん研究を行う研究者たちに無料で提供されます。
「最初は、これほど多くの医療データを譲渡することに違和感を覚えました」とブリュイングトン氏は認めます。しかし、がん研究の進歩に役立つという自身のデータの力を強く信じています。「これは他の人々にも役立つのではないかと考えました」と彼は言います。そして、自身のゲノムについて学べることに興味を持ちました。「私自身が助かることと、他の人々が助かることの間で、私は貢献することが重要だと考えました」と彼は言います。
AACRニュース: 患者を研究パートナーとして
新たなプラットフォームにより、患者はどこに住んでいても臨床データや腫瘍組織を共有することができ、誰もが研究に参加できるチャンスが得られます。
エリン・オドネル著
2024年9月20日
カイル・ブリュイングトン（Kyle Brewington）さん(32)にとって、がんは2006年から現実のものとなっています。13歳の時に左脛骨の骨肉腫と診断されたのでした。10年後、がんは再発しました。2022年、ミズーリ州フレデリックタウン在住のブリュイングトンさんは、別の癌である腎細胞癌と診断されました。癌患者向けのFacebookページをスクロールしていると、臨床データや腫瘍サンプルを研究に提供することをグループのメンバーに呼びかける投稿を目にしました。
その投稿をした人物は、マサチューセッツ州ケンブリッジにあるMITとハーバード大学のブロード研究所が立ち上げたプログラム「Count Me In (CMI)」に最近、自身のデータを寄付したばかりでした。 ブリュイングトンさんは、がんの背後にある科学に興味をそそられ、CMIとブロード研究所の研究について読み始めました。 ブロード研究所の広範なウェブサイトを調べた結果、このプログラムには十分な資金が投入されていると結論付けたことを覚えています。「深く掘り下げて調べていくうちに、『これは本物だ』と思いました」と彼は言います。
CMIに参加することを選択した場合、同プログラムが各担当医に連絡して彼の医療記録や過去の外科手術で切除された腫瘍のサンプルを要求することを許可する同意書に署名することになることを彼は知りました。また、調査票への記入や、ゲノム配列決定用の唾液や血液の提出も行うことになります。これらのデータは匿名化され、がん研究を行う研究者たちに無料で提供されます。
「最初は、これほど多くの医療データを譲渡することに違和感を覚えました」とブリュイングトン氏は認めます。しかし、がん研究の進歩に役立つという自身のデータの力を強く信じています。「これは他の人々にも役立つのではないかと考えました」と彼は言います。そして、自身のゲノムについて学べることに興味を持ちました。「私自身が助かることと、他の人々が助かることの間で、私は貢献することが重要だと考えました」と彼は言います。
データ収集への新たなアプローチ
CMIのようなオンラインプラットフォームは、多くの臨床試験が実施されている都市や総合がんセンターから遠方に住む患者であっても、研究に参加できる新たな方法を提供しています。
「私たち一人一人は、たとえそれが他者の助けになるためであっても、何らかの形で状況をコントロールしたいと強く願っています」と、2010年に血管肉腫と診断され、2015年にCMIの立ち上げに協力したコーリー・ペインター（Corrie Painter）さんは語ります。「(それらの医療記録や組織サンプルを)すべて、疾患の理解と治療に役立てられる実データに変えてみませんか?」
2010年当時、ペインターさんは36歳で、5歳未満の2人の子供の母親でした。生化学の博士号を取得して卒業する準備を進めていたときに、右の乳房に大きなしこりがあることに気づきました。 医師が血管肉腫(血管内皮細胞にできる侵攻性の癌)であることを確認するまでに、ペインターさんはさまざまな検査を受けました。 きわめてまれな疾患で、米国では毎年300人ほどが診断されています。ペインターさんは腫瘍を切除するために乳房切除術を受けました。
科学者であるペインターさんは、自身の癌に関するデータや研究が不足していることに打ちのめされました。「たとえ研究したくても、研究対象となる患者が十分にいないのに、どうやって研究ができるというのでしょうか?」と彼女は問いかけます。また、ペインターさんは、研究者に知らせることができない病理学の保管庫に自分の腫瘍のスライドが保管されていることに苛立ちを感じていました。「私の臨床歴のすべてがそこに眠っているだけで、誰もそこから学ぼうとしませんでした」と彼女は言います。
ボストンのダナファーバーがん研究所のペインターさんの腫瘍医は、化学療法薬による治療を提案し、がんを抑制できる可能性を示唆しました。ペインターさんは2010年にゲムシタビンとパクリタキセルの3サイクルを完了することを選びました。治療後に病気の兆候が認められなかったため、その時点で治療を終了することを決めました。それ以来、彼女は様子を見るアプローチを取り、がん免疫学の博士研究員になるほど健康を取り戻しました。
2015年、ペインターは、自分にぴったりと思われるブロード研究所の職に応募しました。「彼らは、がん研究を理解し、データの収集方法や患者のがん研究への関わり方を抜本的に変えたいと考えている科学者を求めていたのです」と彼女は言います。ペインターさんはすぐに、後にCMIとなるプログラムの科学アウトリーチおよびオペレーション担当副所長として採用されました。2022年、ペインターさんはCMIを退職し、ボストンのプレシード・バイオサイエンスシズ（Precede Biosciences）社で外部研究および提携担当副社長に就任しました。
ブロード研究所（Broad Institute）の科学者たちは、以前から迅速な全ゲノムシークエンシング(個人の遺伝子変異を調べる)と、遺伝子のタンパク質コード領域のみに焦点を当てる全エクソームシークエンシング(エクソーム)解析を先駆けて実施していました。 研究者たちは、腫瘍の進行に関連するものも含め、疾患の原因となる遺伝子変異の85%がエクソームで見つかると推定しています。 この情報は、患者の唾液、血液、腫瘍組織を分析することで取得できます。
CMIは、転移性乳がん患者のデータ収集から取り組みを始めました。ペインターさんは、ソーシャルメディアを通じてこの病気の人々と連絡を取り、彼らと話し合いながら、どのようにすれば彼らの信頼を得て、医療データを研究者に安心して提供してもらえるかを理解するために多くの時間を費やしました。患者たちは、データ収集用ウェブサイトの設計やアンケート質問の微調整を行う際に、ブロード研究所のチームに助言しました。ペインター氏と彼女の同僚は2015年に患者にデータ共有への登録を呼びかけ始め、患者たちは互いにその情報を広めました。
現在、CMIは12,000人を超える患者からデータを収集しており、その中には希少がん患者も含まれています。患者が参加に同意し、同意書と医療情報公開書に署名すると、チームは患者の医療記録と保存された腫瘍サンプルを入手するためにクリニックに連絡を開始します。患者の記録は、研究者が利用できるデジタルデータに変換されます。腫瘍組織は配列決定されます。また、患者には、自身の癌との闘病生活を記述するアンケートへの回答も依頼されます。これらのデータはすべて「匿名化」されますが、患者がこれまでにどのような治療を受けてきたかなど、患者の癌について多くのことを知りたい科学者にとっては、非常に価値のあるデータセットとなります。
CMIの取り組みは貴重な回答をもたらしました。転移性乳がんプロジェクトに続いて血管肉腫プロジェクトが開始されました。300人以上の血管肉腫患者のデータが収集され、そのうち70人のデータを分析したところ、一部の患者に高い腫瘍変異負荷が認められ、キイトルーダ(ペムブロリズマブ)などのチェックポイント阻害剤に良好な反応を示す可能性が高いことがペインターさんによって指摘されました。この観察結果が臨床試験につながりました。「私たちは、このプロジェクトを開始してから2年で、そのがんの臨床的発見に至りました。」とペインターさんは言います。「現在、医師はそのがんを異なる方法で治療しています。」そして、腫瘍変異負荷が高い患者には、チェックポイント阻害剤が投与されています。
転移性前立腺がんに焦点を当てた別のCMIプロジェクトでは、米国とカナダの700人以上の患者のデータを調査しました。このプロジェクトによる2022年の研究では、この疾患に共通する遺伝子変異に関するこれまでの知見が確認されました。また、研究者は、患者の41%が地方や医療過疎地域からであったことを指摘しています。こうした地域は、がん研究では見落とされがちです。
固定組織と生体組織
CMIは固定された腫瘍標本を収集しています。手術中に患者の体内から腫瘍が摘出されると、通常は組織が経時的に変化しないように、ワックスとホルマリンで保存(固定)されます。これらの組織ブロックは室温で保存でき、腫瘍のDNAの配列決定に使用できます。これらのブロックは患者の腫瘍医が治療方針を決定する際に使用される可能性もあるため、CMIは依頼する腫瘍標本の大きさを制限する社内規定を設けました。「私たちは、患者の今後の治療に役立つ可能性のある組織を採取しないよう、確実に配慮しています」と、CMIのプロジェクト戦略・開発担当ディレクターのエラナ・アナスタシオ氏は説明します。
がんの細胞生物学や治療法の研究に役立つ新しい細胞株やマウスモデルの作成という重要な作業には、患者の体内から採取後数時間以内に処理しなければならない生きた腫瘍サンプルが必要です。7年前、希少がん研究財団(RCRF)は、生体組織寄付プログラムPattern.orgを立ち上げ、この課題に取り組みました。
「患者はオンラインで登録し、研究プロトコルに同意することで、この種の研究に取り組む研究者に対して新鮮な生体組織を直接寄付することができます」と、RCRFのマーシャル・トンプソン会長は言います。患者が手術の日時と場所をPattern.orgに知らせると、Pattern.orgチームが外科医や病理医に連絡し、収集キットを送り、必要に応じて手術中の質問にも対応します。「余剰の組織があれば、収集キットに入れ、一晩で生体組織でしかできないモデル開発や最先端の診断を行っている研究者に直接発送します」と彼は言います。
課題は、Pattern.orgについて患者や医師に周知し、手術前に知ってもらうことだとトンプソン氏は言います。Pattern.orgはこれまでに約400人の患者のデータと組織を収集しており、そのおかげで65種類以上の新しい癌細胞株が開発されました。そのほとんどは希少癌の分野です。例えば、ある患者のサンプルがきっかけとなり、2023年に初めて一般公開されたデスモイド腫瘍細胞株が開発されました。
Pattern.orgはまた、生きた腫瘍サンプルを液体窒素で凍結し、手術後も生存可能な状態で保存できるバイオバンクの開発も進めています。
希少な情報に対するソリューション
あらゆる種類のデータを集約することは、特に希少な癌の研究に役立ちます。ケイティ・コールマンさんの話を考えてみましょう。2020年、29歳の新婚の彼女は、腹部の右側に硬いしこりがあることに気づきました。彼女は数ヶ月前から、高血圧、心拍数の増加、激しい腹痛などの症状を経験していましたが、複数の医師は、それらの症状は彼女の月経周期と不安によるものだと考えていました。
お腹に腫瘤があることに気づいたコールマンさんは、病院の救急外来を受診し、超音波検査で右の腎臓にソフトボール大の腫瘍があり、肝臓にも多数の小さな腫瘍があることが判明しました。 放射線科の報告書では、コールマンさんは2つのタイプの転移性腎臓がん、すなわち、非常にまれなクロモフォーブ腎細胞がんまたはオンコサイトーマのいずれかである可能性が高いとされました。
腫瘍科の初診、生体検査、セカンドオピニオンと目まぐるしく続く中、コールマンさんはこれらの癌についてできる限り情報を集めようとしましたが、驚くほど情報が少ないことが分かりました。最終的にコールマンさんは、通常は非癌性の腫瘍であるオンコサイトーマと診断されました。しかし、コールマンさんのように、まれに腫瘍が悪性となり、肝臓や骨に転移するケースもあります。
この症例はきわめてまれで、これまでに10例未満しか記録されていないため、ほとんどの腫瘍専門医は、このがんの患者を診ることはないでしょう。コールマンさんは当初、手術の対象ではないと言われ、予後も厳しいと告げられました。
テキサス州オースティンに住むコールマンさんは、まれな腎臓がん患者とオンラインでつながり、最終的にメリーランド州ベセスダにある国立がん研究所（NCI)の医師たちと出会いました。そのうちの1人は、オンコサイトーマの治療経験がありました。彼らの勧めで、彼女は原発腫瘍と右腎臓、および肝臓の5つの部位を切除する手術を受けました。さらに、肝臓に残った腫瘍を治療するためにアブレーションも受けました。これらの治療により、現在33歳のコールマンさんは、活動性の癌は一切なく、まれな癌患者が団結して助け合うことの大切さを深く理解しています。
コールマンさんは、まれな腎臓癌、特に彼女の癌よりもまれではあるが、より一般的なクロモフォーブ腎癌の患者を支援する活動を始めました。2023年には、クロモフォブ細胞腫およびオンコサイト腫瘍同盟（the Chromophobe and Oncocytic Tumor Alliance,）を設立し、患者たちに影響を与えたいと願っています。
コールマンさんは、希少な腎臓がんに関する情報が一元化されていないという問題に対処するために、ソフトウェアエンジニアとしてのスキルを活用することを決意しました。ヒューストンにあるテキサス大学MDアンダーソンがんセンターの腫瘍医パブロス・マサエル氏との共著論文に触発されたのです。その論文は、免疫療法に対するクロモフォーブ腎がんの限定的な反応率に焦点を当て、さまざまな腎がんの分子特性について説明していました。当時、多くの患者がコールマンに免疫療法について尋ねていました。免疫療法は、より一般的な腎がんの亜型を治療するために処方されることが多いからです。「私は、この論文を地域の腫瘍専門医に見てもらう必要がありました。彼らはこの情報を把握しておらず、異なる治療を処方していたのです。
2023年の長い連休の週末に、コールマンはこれらの腎臓がんに関する大量の情報を統合するアプリを開発しました。「私の目標は、この分野に新たに参入した研究者が、入手可能な情報が豊富な乳がんか、それとも情報が非常に見つけにくい希少がんのどちらかを選択しなければならない場合、彼らを支援し、より良いスタート地点を提供することでした」と彼女は言います。
誰のデータなのか?
医療データや組織サンプルの所有権に関する規制は、それらの共有や利用の方法に影響を与えます。
コールマンさんのアプリは、2023年の米国臨床腫瘍学会年次総会の直前に公開され、そこで彼女は偶然にもパターン・ドット・オーグのバーバラ・ヴァン・ヘア会長と出会いました。コールマンさんはすぐにRCRFに採用され、まもなく彼女のアプリの改良版である「Rare Cancer Research Hub」が発表される予定です。Pattern.orgは、コールマンさんが作成したオンラインポータルも提供しており、患者は臨床医や研究者と自身のデータや病歴を共有することができます。
データ共有に関する疑問
コールマンさんは、Pattern.orgのようなプラットフォームで自身のデータを共有することに意欲的です。「私は共有することに抵抗はありません。なぜなら、私が何よりも重視しているのは研究の前進だからです」と彼女は言います。
しかし、自分のデータを共有することに不安を感じたり、参加しない理由がある人もいるでしょう。カイル・ブリュイニングトン氏は、他の患者との会話の中で、自分の遺伝子に関するデータにアクセスできるだけでも参加するよう勧めています。しかし、小児がんの場合、患者や患者の両親が研究に参加できる状態にない場合もあると彼は指摘します。「治療の最中であり、子供が生き延びられるかどうかの方が心配なのです。
CMIとRCRFはプライバシーを重視しており、研究者とデータを共有する前に、データと組織は匿名化されるよう徹底しています。しかし、ペインター氏は、このようなデータ共有は万人向けではないと述べています。「本当に心配なことがある場合は、参加しないでください」と彼女は言います。彼女は、データ共有の潜在的なリスクについて透明性を確保することが重要だと考えています。「リスクは非常に低い」と彼女は言いますが、どのようなプラットフォームでもデータ共有にはリスクが伴います。CMIのエレナ・アナスタシオ氏は、「患者さんがプロセス、データ、その他のいずれかに不安を感じている場合は、いつでも患者さんと話し合います」と付け加えています。同氏は、CMIはデータ共有に不安を感じながらも、CMIを支持し、友人やソーシャルメディアの連絡先に情報を広めてくれる患者さんともつながっていると述べています。
患者がどのような形で参加しようとも、こうした取り組みの成功は、がん患者一人一人が自らの疾患に関する知識を深める上で大きな力を発揮することを示している、とRCRFの戦略的パートナーシップ担当ディレクターであるスーザン・ホーレル氏は述べています。「世界中のどこにいても、どこの病院でも、誰もが研究に貢献できる機会があります」と彼女は言います。
エリン・オドネル氏は、ミルウォーキー在住の健康・科学ライターです。
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